本科教育对一所大学的底色起着决定性作用，博士生教育则衡量大学所能呈现的高度，这两者一起共同形成了人才培养无法分割的整体。
本科教育的底色决定大学根基
在青年学生价值观得以形成、思维方式被塑造的关键那四年本科阶段，清华大学校长邱勇于2016年就撰写文章表明，一流本科教育乃是一流大学的底色，此阶段的教育质量会对学生未来的发展潜力产生直接影响，并且这也是大学最为核心的教学任务。
本科教育是一所大学传承其传统与特色的途径，本科阶段里通识教育跟专业基础相结合，为学生供给了宽厚的知识储备。并且教师和本科生密切互动，还有校园文化的熏陶都在不知不觉中塑造着学生的品格及视野。
博士生教育代表人才培养高度
处于学历教育金字塔顶端的是博士生教育，其质量直接映射国家的人才培养水准，从古至今博士这一称谓都与学问探索紧密关联，自12世纪问世伊始，博士便是加入教师行会的资格凭证，意味着学术能力的权威认定。
自哲学博士被设立以来，现代博士生教育一直把独立去从事学术研究、创造出新知识当作核心目标。博士生不单单是知识的接受者，更是学术精神的传承者以及光大者，他们要立下志向变为推动学科边界往前拓展的中坚力量。
学术精神是博士生教育的灵魂
包含科学理性精神以及学术奉献精神的学术精神，乃是学者于学术活动里所坚守的价值准则，博士生在学习期间所处的阶段，是培养学术精神最为重要的时刻，他们得去接受严谨的学术训练，借由发表论文、参与学术活动以此来证明自身的学术能力。
尤为关键的是，博士生需将对学术的那份热爱融入自身生命之中。在2016年的时候，清华大学所秉持的教育理念着重表明，博士生应当培育学术志趣，视捍卫真理为一生的追求。这样的一种精神，不但对未来的学术事业有着服务作用，而且对于博士生一生的职业发展都会产生深刻且长远的影响。
独创性和批判性思维不可或缺
曾在80年代初，诺贝尔物理学奖得主杨振宁，对九十多名中国学生提出，独创性是科学工作者最为重要的素质，博士生应当以独立之精神、自由之思想要求自己，要勇于挑战最前沿的科学问题，在独创性方面下功夫。
缺乏那种批判性思维，曾被视作是中国学生的弱项。国际上的研究显示，去培养学生用批判且质疑的眼光去看待权威，这同样不是容易的事情。清华大学在2013年发起了巅峰对话，让学生能够自主去邀请学术大师一同进行对话，有教授发出感叹，称这是自己所听到的对于清华学生的最高评价。
构建全方位的博士生教育体系
以贯穿始终的一流教育理念，才会有一流的博士生教育。选拔环节并非简单依据考分录取，而是着重对学术志趣以及创新潜力予以评价。知识结构固然有着重要性，然而考分并不能全然体现出学生的学术潜质，创新潜力更为关键。
论资排辈这种方式不能用于导师确认方面。清华在2009年起把博导评定权下放给了分委员会，近些年更是明确教研系列助理教授能够独立去指导博士生。让充满创造活力的青年教师去指导优秀学生，师生彼此促进，共同实现成长。
突破界限促进跨学科交流合作
激发博士生创造力的重要途径乃是跨学科交流，博士生论坛持续举办达500期，开展了一万八千多场次学术报告，切实发挥出学科交融的作用，清华积极对博士生出国交流予以资助，超过60%的博士生拥有海外访学经历。
2011年时学校设立了发展中国家博士生项目，该项目鼓励学生去亲身体验调研 ，在博士学位评定方面 ，权力进一步被下放到院系二级单位 ，使得各领域学者负责学术判断 ，这些举措均在推动博士生培养质量迈向新的高度。
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